cctbx.covariance
index
/net/chevy/raid1/nat/src/cctbx_project/cctbx/covariance/__init__.py

 
Package Contents
       

 
Functions
       
covariance_orthogonalization_matrix(...)
covariance_orthogonalization_matrix( (unit_cell)unit_cell, (parameter_map)parameter_map) -> matrix :
 
    C++ signature :
        scitbx::sparse::matrix<double> covariance_orthogonalization_matrix(cctbx::uctbx::unit_cell,cctbx::xray::parameter_map<cctbx::xray::scatterer<double, std::string, std::string> >)
extract_covariance_matrix_for_sites(...)
extract_covariance_matrix_for_sites( (size_t)i_seqs, (double)matrix, (parameter_map)parameter_map) -> double :
 
    C++ signature :
        scitbx::af::versa<double, scitbx::af::packed_u_accessor> extract_covariance_matrix_for_sites(scitbx::af::const_ref<unsigned long, scitbx::af::trivial_accessor>,scitbx::af::const_ref<double, scitbx::af::packed_u_accessor>,cctbx::xray::parameter_map<cctbx::xray::scatterer<double, std::string, std::string> >)
extract_covariance_matrix_for_u_aniso(...)
extract_covariance_matrix_for_u_aniso( (int)i_seq, (double)matrix, (parameter_map)parameter_map) -> double :
 
    C++ signature :
        scitbx::af::versa<double, scitbx::af::packed_u_accessor> extract_covariance_matrix_for_u_aniso(unsigned long,scitbx::af::const_ref<double, scitbx::af::packed_u_accessor>,cctbx::xray::parameter_map<cctbx::xray::scatterer<double, std::string, std::string> >)
orthogonalize_covariance_matrix(...)
orthogonalize_covariance_matrix( (double)matrix, (unit_cell)unit_cell, (parameter_map)parameter_map) -> double :
 
    C++ signature :
        scitbx::af::versa<double, scitbx::af::packed_u_accessor> orthogonalize_covariance_matrix(scitbx::af::const_ref<double, scitbx::af::packed_u_accessor>,cctbx::uctbx::unit_cell,cctbx::xray::parameter_map<cctbx::xray::scatterer<double, std::string, std::string> >)
variance_for_u_iso(...)
variance_for_u_iso( (int)i_seq, (double)matrix, (parameter_map)parameter_map) -> float :
 
    C++ signature :
        double variance_for_u_iso(unsigned long,scitbx::af::const_ref<double, scitbx::af::packed_u_accessor>,cctbx::xray::parameter_map<cctbx::xray::scatterer<double, std::string, std::string> >)

 
Data
        division = _Feature((2, 2, 0, 'alpha', 2), (3, 0, 0, 'alpha', 0), 8192)