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		gruber_1973 gruber_1973_table_1 krivy_gruber_1976 reduction_base

Classes
		__builtin__.object non_crystallographic_unit_cell_with_the_sites_in_its_center cctbx_uctbx_ext.unit_cell(Boost.Python.instance) unit_cell   class non_crystallographic_unit_cell_with_the_sites_in_its_center(__builtin__.object)       Methods defined here: __init__(self, sites_cart, buffer_layer, min_unit_cell_length=0) Data descriptors defined here: __dict__ dictionary for instance variables (if defined) __weakref__ list of weak references to the object (if defined)   class unit_cell(cctbx_uctbx_ext.unit_cell)       Method resolution order: unit_cell cctbx_uctbx_ext.unit_cell Boost.Python.instance __builtin__.object Methods defined here: __init__(self, parameters=None, metrical_matrix=None, orthogonalization_matrix=None) Methods inherited from cctbx_uctbx_ext.unit_cell: __getinitargs__(...) __getinitargs__( (unit_cell)arg1) -> tuple :       C++ signature :         boost::python::tuple __getinitargs__(cctbx::uctbx::unit_cell) __reduce__ = (...) __str__(self) bases_mean_square_difference(...) bases_mean_square_difference( (unit_cell)arg1, (unit_cell)other) -> float :       C++ signature :         double bases_mean_square_difference(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::uctbx::unit_cell) box_frac_around_sites(self, sites_cart=None, sites_frac=None, buffer=None) buffer_shifts_frac(self, buffer) change_basis(...) change_basis( (unit_cell)arg1, (object)c_inv_r [, (float)r_den=1.0]) -> unit_cell :       C++ signature :         cctbx::uctbx::unit_cell change_basis(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::mat3<double> [,double=1.0])   change_basis( (unit_cell)arg1, (change_of_basis_op)cb_op) -> unit_cell :       C++ signature :         cctbx::uctbx::unit_cell change_basis(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::sgtbx::change_of_basis_op) change_of_basis_op_for_best_monoclinic_beta(...) change_of_basis_op_for_best_monoclinic_beta( (unit_cell)arg1) -> change_of_basis_op :       C++ signature :         cctbx::sgtbx::change_of_basis_op change_of_basis_op_for_best_monoclinic_beta(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue}) compare_monoclinic(...) compare_monoclinic( (unit_cell)arg1, (unit_cell)other, (int)unique_axis, (float)angular_tolerance) -> int :       C++ signature :         int compare_monoclinic(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::uctbx::unit_cell,unsigned int,double) compare_orthorhombic(...) compare_orthorhombic( (unit_cell)arg1, (unit_cell)other) -> int :       C++ signature :         int compare_orthorhombic(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::uctbx::unit_cell) d(...) d( (unit_cell)arg1, (object)miller_index) -> float :       C++ signature :         double d(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::miller::index<int>)   d( (unit_cell)arg1, (miller_index)miller_indices) -> double :       C++ signature :         scitbx::af::shared<double> d(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::af::const_ref<cctbx::miller::index<int>, scitbx::af::trivial_accessor>) d_star_sq(...) d_star_sq( (unit_cell)arg1, (object)miller_index) -> float :       C++ signature :         double d_star_sq(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::miller::index<int>)   d_star_sq( (unit_cell)arg1, (miller_index)miller_indices) -> double :       C++ signature :         scitbx::af::shared<double> d_star_sq(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::af::const_ref<cctbx::miller::index<int>, scitbx::af::trivial_accessor>) distance(...) distance( (unit_cell)arg1, (object)site_frac_1, (object)site_frac_2) -> float :       C++ signature :         double distance(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::fractional<double>,cctbx::fractional<double>) fractionalization_matrix(...) fractionalization_matrix( (unit_cell)arg1) -> tuple :       C++ signature :         scitbx::mat3<double> fractionalization_matrix(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue}) fractionalize(...) fractionalize( (unit_cell)arg1, (object)site_cart) -> tuple :       C++ signature :         scitbx::vec3<double> fractionalize(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::vec3<double>)   fractionalize( (unit_cell)arg1, (vec3_double)sites_cart) -> vec3_double :       C++ signature :         scitbx::af::shared<scitbx::vec3<double> > fractionalize(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::af::const_ref<scitbx::vec3<double>, scitbx::af::trivial_accessor>) is_buerger_cell(self, relative_epsilon=None) is_degenerate(...) is_degenerate( (unit_cell)arg1 [, (float)min_min_length_over_max_length=1e-10 [, (float)min_volume_over_min_length=1.0000000000000001e-05]]) -> bool :       C++ signature :         bool is_degenerate(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue} [,double=1e-10 [,double=1.0000000000000001e-05]]) is_niggli_cell(self, relative_epsilon=None) is_similar_to(...) is_similar_to( (unit_cell)arg1, (unit_cell)other [, (float)relative_length_tolerance=0.01 [, (float)absolute_angle_tolerance=1.0]]) -> bool :       C++ signature :         bool is_similar_to(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::uctbx::unit_cell [,double=0.01 [,double=1.0]]) length(...) length( (unit_cell)arg1, (object)site_frac) -> float :       C++ signature :         double length(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::fractional<double>) longest_vector_sq(...) longest_vector_sq( (unit_cell)arg1) -> float :       C++ signature :         double longest_vector_sq(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue}) max_d_star_sq(...) max_d_star_sq( (unit_cell)arg1, (miller_index)miller_indices) -> float :       C++ signature :         double max_d_star_sq(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::af::const_ref<cctbx::miller::index<int>, scitbx::af::trivial_accessor>) max_miller_indices(...) max_miller_indices( (unit_cell)arg1, (float)d_min [, (float)tolerance=0.0001]) -> tuple :       C++ signature :         cctbx::miller::index<int> max_miller_indices(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},double [,double=0.0001]) metrical_matrix(...) metrical_matrix( (unit_cell)arg1) -> tuple :       C++ signature :         scitbx::sym_mat3<double> metrical_matrix(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue}) min_max_d_star_sq(...) min_max_d_star_sq( (unit_cell)arg1, (miller_index)miller_indices) -> tuple :       C++ signature :         scitbx::af::tiny<double, 2ul> min_max_d_star_sq(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::af::const_ref<cctbx::miller::index<int>, scitbx::af::trivial_accessor>) min_mod_short_distance(...) min_mod_short_distance( (unit_cell)arg1, (vec3_double)site_frac_1, (object)site_frac_2) -> float :       C++ signature :         double min_mod_short_distance(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::af::const_ref<scitbx::vec3<double>, scitbx::af::trivial_accessor>,cctbx::fractional<double>) minimum_cell(self, iteration_limit=None, multiplier_significant_change_test=None, min_n_no_significant_change=None) minimum_reduction(self, iteration_limit=None, multiplier_significant_change_test=None, min_n_no_significant_change=None) mod_short_distance(...) mod_short_distance( (unit_cell)arg1, (object)site_frac_1, (object)site_frac_2) -> float :       C++ signature :         double mod_short_distance(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::fractional<double>,cctbx::fractional<double>) mod_short_length(...) mod_short_length( (unit_cell)arg1, (object)site_frac) -> float :       C++ signature :         double mod_short_length(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::fractional<double>) niggli_cell(self, relative_epsilon=None, iteration_limit=None) niggli_reduction(self, relative_epsilon=None, iteration_limit=None) orthogonalization_matrix(...) orthogonalization_matrix( (unit_cell)arg1) -> tuple :       C++ signature :         scitbx::mat3<double> orthogonalization_matrix(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue}) orthogonalize(...) orthogonalize( (unit_cell)arg1, (object)site_frac) -> tuple :       C++ signature :         scitbx::vec3<double> orthogonalize(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::vec3<double>)   orthogonalize( (unit_cell)arg1, (vec3_double)sites_frac) -> vec3_double :       C++ signature :         scitbx::af::shared<scitbx::vec3<double> > orthogonalize(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::af::const_ref<scitbx::vec3<double>, scitbx::af::trivial_accessor>) parameters(...) parameters( (unit_cell)arg1) -> tuple :       C++ signature :         scitbx::af::tiny<double, 6ul> parameters(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue}) reciprocal(...) reciprocal( (unit_cell)arg1) -> unit_cell :       C++ signature :         cctbx::uctbx::unit_cell reciprocal(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue}) reciprocal_metrical_matrix(...) reciprocal_metrical_matrix( (unit_cell)arg1) -> tuple :       C++ signature :         scitbx::sym_mat3<double> reciprocal_metrical_matrix(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue}) reciprocal_parameters(...) reciprocal_parameters( (unit_cell)arg1) -> tuple :       C++ signature :         scitbx::af::tiny<double, 6ul> reciprocal_parameters(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue}) shortest_vector_sq(...) shortest_vector_sq( (unit_cell)arg1) -> float :       C++ signature :         double shortest_vector_sq(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue}) show_parameters(self, f=None, prefix='Unit cell: ') similarity_transformations(...) similarity_transformations( (unit_cell)arg1, (unit_cell)other [, (float)relative_length_tolerance=0.02 [, (float)absolute_angle_tolerance=2 [, (int)unimodular_generator_range=1]]]) -> mat3_int :       C++ signature :         scitbx::af::shared<scitbx::mat3<int> > similarity_transformations(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::uctbx::unit_cell [,double=0.02 [,double=2 [,int=1]]]) stol(...) stol( (unit_cell)arg1, (object)miller_index) -> float :       C++ signature :         double stol(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::miller::index<int>)   stol( (unit_cell)arg1, (miller_index)miller_indices) -> double :       C++ signature :         scitbx::af::shared<double> stol(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::af::const_ref<cctbx::miller::index<int>, scitbx::af::trivial_accessor>) stol_sq(...) stol_sq( (unit_cell)arg1, (object)miller_index) -> float :       C++ signature :         double stol_sq(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::miller::index<int>)   stol_sq( (unit_cell)arg1, (miller_index)miller_indices) -> double :       C++ signature :         scitbx::af::shared<double> stol_sq(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::af::const_ref<cctbx::miller::index<int>, scitbx::af::trivial_accessor>) two_stol(...) two_stol( (unit_cell)arg1, (object)miller_index) -> float :       C++ signature :         double two_stol(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::miller::index<int>)   two_stol( (unit_cell)arg1, (miller_index)miller_indices) -> double :       C++ signature :         scitbx::af::shared<double> two_stol(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::af::const_ref<cctbx::miller::index<int>, scitbx::af::trivial_accessor>) two_theta(...) two_theta( (unit_cell)arg1, (object)miller_index, (float)wavelength [, (bool)deg=False]) -> float :       C++ signature :         double two_theta(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},cctbx::miller::index<int>,double [,bool=False])   two_theta( (unit_cell)arg1, (miller_index)miller_indices, (float)wavelength [, (bool)deg=False]) -> double :       C++ signature :         scitbx::af::shared<double> two_theta(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue},scitbx::af::const_ref<cctbx::miller::index<int>, scitbx::af::trivial_accessor>,double [,bool=False]) volume(...) volume( (unit_cell)arg1) -> float :       C++ signature :         double volume(cctbx::uctbx::unit_cell {lvalue}) Data and other attributes inherited from cctbx_uctbx_ext.unit_cell: __safe_for_unpickling__ = True Data descriptors inherited from Boost.Python.instance: __dict__ __weakref__ Data and other attributes inherited from Boost.Python.instance: __new__ = <built-in method __new__ of Boost.Python.class object at 0x2aaaac5444a0> T.__new__(S, ...) -> a new object with type S, a subtype of T

Functions
		d_star_sq_as_d(...) d_star_sq_as_d( (float)arg1) -> float :       C++ signature :         double d_star_sq_as_d(double) d_star_sq_as_stol(...) d_star_sq_as_stol( (float)arg1) -> float :       C++ signature :         double d_star_sq_as_stol(double) d_star_sq_as_stol_sq(...) d_star_sq_as_stol_sq( (float)arg1) -> float :       C++ signature :         double d_star_sq_as_stol_sq(double) d_star_sq_as_two_stol(...) d_star_sq_as_two_stol( (float)arg1) -> float :       C++ signature :         double d_star_sq_as_two_stol(double) d_star_sq_as_two_theta(...) d_star_sq_as_two_theta( (float)arg1, (float)arg2 [, (bool)arg3]) -> float :       C++ signature :         double d_star_sq_as_two_theta(double,double [,bool]) fractional_unit_shifts(...) fractional_unit_shifts( (object)distance_frac) -> tuple :       C++ signature :         scitbx::vec3<int> fractional_unit_shifts(cctbx::fractional<double>)   fractional_unit_shifts( (object)site_frac_1, (object)site_frac_2) -> tuple :       C++ signature :         scitbx::vec3<int> fractional_unit_shifts(cctbx::fractional<double>,cctbx::fractional<double>) non_crystallographic_buffer_layer(sites_cart_min, sites_cart_max, default_buffer_layer=0.5) non_crystallographic_unit_cell(sites_cart=None, sites_cart_min=None, sites_cart_max=None, buffer_layer=None, default_buffer_layer=0.5, min_unit_cell_length=0)

Data
		__warningregistry__ = {("Not importing directory '/net/chevy/raid1/rwgk/dist/scitbx/matrix': missing __init__.py", <type 'exceptions.ImportWarning'>, 8): 1}