mmtbx.disorder
index
/net/chevy/raid1/nat/src/cctbx_project/mmtbx/disorder/__init__.py

Tools for analyzing disorder (or heterogeneity in general) in ensembles and
and other multi-conformer models or collections of conformations.  For building
and refinement of such models, see mmtbx.building.alternate_conformations or
mmtbx.refinement.ensemble_refinement.

 
Package Contents
       
analyze_model
backbone
tst
tst_analyze_model
tst_backbone

 
Functions
       
set_ensemble_b_factors_to_xyz_displacement(pdb_hierarchy, include_hydrogens=False, include_waters=False, use_c_alpha_values=False, method='rmsf', selection=None, substitute_b_value=-1.0, logarithmic=False, log=None)
Given an ensemble (multi-MODEL PDB hierarchy), calculate the deviation
between copies of each atom (defined here as either the root-mean-square
fluctuation, or the radius of the minimum covering sphere) and set the
isotropic B-factors to this value.

 
Data
        division = _Feature((2, 2, 0, 'alpha', 2), (3, 0, 0, 'alpha', 0), 8192)