mmtbx.ncs
index
/net/chevy/raid1/nat/src/cctbx_project/mmtbx/ncs/__init__.py

 
Package Contents
       
ligands
ncs
restraints
tst_asu_as_one_ncs_copy
tst_restraints
tst_restraints_2

 
Classes
       
__builtin__.object
asu_ncs_converter

 
class asu_ncs_converter(__builtin__.object)
    Simple method of converting multiple NCS copy ASU content into one NCS copy
and NCS transformations. Limitations:
  - Asumes each chain to be individual NCS copy.
  - Takes first NCS copy as the master copy.
  - Assume all copies are identical (number and order of atoms)
  - Anisotropic ADP are not handlesd.
Further improvements: use atom selections to identify NCS copies.
 
  Methods defined here:
__init__(self, pdb_hierarchy, eps=0.01, add_identity=True)
is_ncs_present(self)
update_sites_cart(self, sites_cart_master_ncs_copy)
write_pdb_file(self, file_name, crystal_symmetry, mode)

Data descriptors defined here:
__dict__
dictionary for instance variables (if defined)
__weakref__
list of weak references to the object (if defined)

 
Data
        division = _Feature((2, 2, 0, 'alpha', 2), (3, 0, 0, 'alpha', 0), 8192)